Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssx9Q6XAS3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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