Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms