Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja3Q64448 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms