Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf180Q3U827 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf180Q3U827 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms