Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp39Q3TIX9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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