Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hddc2Q3SXD3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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