Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms