Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc3P49135 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms