Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc10P31257 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms