Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gcm2O09102 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms