Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc71lE9Q4T4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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