Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms