Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap29-1A2A5X4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms