Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a4Q9QZR9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Col4a4Q9QZR9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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