Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn22Q9D7U6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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