Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nicn1Q9CQM0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nicn1Q9CQM0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nicn1Q9CQM0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms