Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms