Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms