Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms