Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp1Q8C8C1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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