Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp398Q8BV16 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms