Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga6Q61739 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms