Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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JrkQ60976 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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JrkQ60976 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
JrkQ60976 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms