Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms