Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vps8Q0P5W1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms