Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfixP70257 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NfixP70257 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfixP70257 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfixP70257 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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NfixP70257 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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NfixP70257 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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NfixP70257 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfixP70257 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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NfixP70257 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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NfixP70257 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfixP70257 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfixP70257 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfixP70257 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfixP70257 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfixP70257 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NfixP70257 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NfixP70257 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NfixP70257 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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NfixP70257 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms