Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHP20396 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHP20396 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHP20396 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHP20396 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHP20396 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms