Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms