Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa7P02830 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms