Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Serf1O88892 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms