Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms