Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubiad1Q9DC60 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms