Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms