Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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