Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms