Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ctf1Q60753 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms