Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tubg1P83887 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms