Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRMP28827 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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