Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TtrP07309 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TtrP07309 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms