Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms