Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pramef6A2A8M8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms