Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd1Q9Z2E2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd1Q9Z2E2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms