Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nek4Q9Z1J2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nek4Q9Z1J2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nek4Q9Z1J2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nek4Q9Z1J2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms