Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnni1Q9WUZ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni1Q9WUZ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni1Q9WUZ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni1Q9WUZ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms