Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scnn1bQ9WU38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scnn1bQ9WU38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scnn1bQ9WU38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms