Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skp1Q9WTX5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skp1Q9WTX5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skp1Q9WTX5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms