Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb3Q9R1P1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb3Q9R1P1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms