Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nek3Q9R0A5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nek3Q9R0A5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms