Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf4Q9QZS2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf4Q9QZS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf4Q9QZS2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms