Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gpc1Q9QZF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Gpc1Q9QZF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpc1Q9QZF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Gpc1Q9QZF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc1Q9QZF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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